2011年，呼和浩特轨道交通建设列入“十二五”规划。
2012年12月，呼和浩特市政府批复《呼和浩特轨道交通线网规划》。
2014年11月，中国环境保护部批复《呼和浩特轨道交通线网规划》。
2015年4月15日，中国国家发展和改革委员会批复《呼和浩特市城市轨道交通近期建设规划（2015~2020年）》；8月20日，呼和浩特地铁1、2号线开工建设；9月8日，呼和浩特地铁进入地质详勘阶段 ；10月24日，呼和浩特地铁1、2号线一期工程总体设计通过专家评审。
2018年11月26日，呼和浩特地铁1号线盾构区间全部贯通。
2019年7月10日，呼和浩特地铁1号线接触网送电成功；7月19日，呼和浩特地铁1号线完成热滑试验；8月13日，呼和浩特地铁1号线全线“轨通”；9月6日，呼和浩特地铁1号线开始试运行；9月11日，呼和浩特地铁2号线全线贯通；12月29日，呼和浩特地铁1号线开通试运营。
2020年1月6日，呼和浩特地铁2号线一期工程接触网送电成功；1月8日，呼和浩特地铁2号线实现全线“轨通”；1月28日12时起，因疫情防控需要，呼和浩特地铁1号线临时停运；2月28日，呼和浩特地铁1号线恢复运行； 5月20日，呼和浩特地铁2号线开始试运行 ；6月，青城地铁APP和北京轨道交通亿通行APP实现“互联互通”，在呼和浩特地铁、北京地铁实现通用；10月1日，呼和浩特地铁2号线正式开通试运营；同月，呼和浩特地铁全线开通银联云闪付APP乘车码扫码过闸。
2021年5月，呼和浩特地铁与中国银联合作推出闪付卡、手机pay、手环银联闪付乘车功能；12月23日起，呼和浩特地铁与上海地铁实现乘车码互联互通 。
2022年1月28日起，呼和浩特地铁与天津轨道交通乘车码实现互联互通；6月17、18日，呼和浩特地铁1、2号线进行免费乘车活动；8月8日19时17分，呼和浩特地铁1、2号线线网总客流量突破1亿人次 。
2023年2月13日，呼和浩特城市轨道交通1号线一期工程转入正式运营 。
